LPM adalah salah satu lembaga yang memegang peranan penting dalam pelaksanaan penjaminan mutu di perguruan tinggi. Adapun struktur organisasi Lembaga Penjaminan Mutu di Politeknik Muhammadiyah Makassar adalah sebagai berikut:
LPM mempunyai tugas melaksanakan pengembangan standar mutu dan audit di bidang pendidikan, penelitian, pengabdian kepada masyarakat, dan kemahasiswaan.
Lembaga Penjaminan Mutu memiliki fungsi:
- Perencana dan pelaksanaan sistem penjaminan mutu akademik internal secara keseluruhan di Politeknik Muhammadiyah Makassar;
- Penyusun perangkat dokumen kebijakan akademik, dokumen mutu, dan formulir mutu yang diperlukan dalam rangka pelaksanaan sistem penjaminan mutu;
- Pelaksanaan monitoring sistem penjaminan mutu internal;
- Pelaksanaan audit mutu internal;
- Pelaksanaan evaluasi pelaksanaan sistem penjaminan mutu internal;
- Melakukan koordinasi dengan Gugus Kendali Mutu yang berada di masing-masing prodi.